Det er bedre at opbevare peptides i køleskabet, fordi lav temperaturer hjælper med at bevare deres kemiske struktur og forhindre nedbrydning. Ved lavere temperaturer reduceres den enzymatiske aktivitet og oxidation, som kan forringe peptidernes effektivitet og stabilitet. Desuden beskytter køleskabet mod fugt og lys, som også kan skade peptiderne. Alt i alt forlænges holdbarheden, og kvaliteten bevares bedst, når peptides opbevares ved køl.